南科遺址的發掘是國內近年來重要的考古工作，遺址年代最早可上溯至今4800年，共發現25處考古遺址，已發掘15處，涵蓋了大坌坑、牛稠子、大湖、蔦松、西拉雅、漢人等文化，最著名的就是道爺古墓遺址，南科遺址出土了豐富的陶片、石器，並發現漢人「糖 連灶」遺跡和
大湖期堆積等多元豐富的文物。為了讓國人瞭解與認識這批珍貴的文化資產，於是成立南科考古文物陳列室，以圖片、文物展示為主，並加以文字說明、導覽解說，方便國人可以更了解南科。